Сътрудничество на Департамента

• Национален природонаучен музей
• Национален музей „Земята и хората“
• Висше строително училище „Любен Каравелов“
• Институт за космически изследвания и технологии – БАН
• Институт по астрономия с Национална астрономическа обсерватория „Рожен“ – БАН
• Институт по биоразнообразие и екосистемни изследвания – БАН
• Институт по микробиология „Стефан Ангелов“ – БАН
• Институт по почвознание, агротехнологии и защита на растенията „Никола Пушкаров“
• Национален институт по геофизика, геодезия и география – БАН
• Институт за ядрени изследвания и ядрена енергетика - БАН
• Съюз на учените
• Българско микробиологично дружество
• Министерство на околната среда и водите
• Изпълнителна агенция по околна среда към Министерство на околната среда и водите
• Министерство на земеделието и храните
• Лесозащитна станция – София към Изпълнителна агенция по гори към
• Българска агенция по безопасност на храните
• Държавно предприятие „Радиоактивни отпадъци“ – София
• Асоциация на българските градове и региони
• Екологично сдружение „За Земята“
• Фондация „Екообщност“
• Национално дружество „Екологично инженерство и опазване на околната среда”
• Медикодиагностична лаборатория „Ескулап“ ЕООД
• „Проген“ ООД
• Instiute for geobiology, arheology, underground waters and ecology (IGAPE) – Скопие, Македония
• Общини
• Частни биологични лаборатории